分裂 GTB 文件
使用如下指令分裂 GTB 文件为多个独立的子文件:
split <input> -o <output> [options]
程序参数
语法: split <input> -o <output> [options]
参数:
--contig 指定染色体标签文件.
默认值: /contig/human/hg38.p13
格式: --contig <file> (Exists,File,Inner)
*--output,-o 设置输出文件名.
格式: --output <file>
--by 按照染色体水平/节点水平分裂 GTB 文件为多个子文件.
默认值: chromosome
格式: --by <string> ([chromosome/node] or [0/1])
--yes,-y 覆盖输出文件.
程序实例
按照染色体编号拆分 ./example/1000GP3.gtb
文件:
# Linux 或 MacOS
docker run -v `pwd`:`pwd` -w `pwd` --rm -it -m 500m gbc \
split ./example/1000GP3.gtb -o ./example/1000GP3-chr -y
# Windows
docker run -v %cd%:%cd% -w %cd% --rm -it -m 500m gbc split ./example/1000GP3.gtb -o ./example/1000GP3-chr -y
运行该指令后,文件夹 1000GP30-chr
中产生 24 个 GTB 子文件。